肝炎ウイルスマーカー
①A型肝炎ウイルス（HAV）の検査
A型肝炎は、はしかのように一度罹れば抗体ができ、終生免疫を獲得する。A型肝炎にかかると、１-４週の間にIgM型HA抗体と呼ばれるHAVに対する抗体が血液中に増加してくるので、この抗体を測定することでＡ型肝炎の早期診断が可能である。以前にA型肝炎にかかったか、知らないうちにA型肝炎ウイルスに対する抗体が出来ているかを見るのはIgG型HA抗体を調べるとわかる。
②B型肝炎ウイルス（HBV）の検査
B型肝炎ウイルス（デーン粒子）は直径42nmの球型、二重構造のDNAウイルスで、リンゴなら皮にあたる部分（HBs抗原）と芯（HBc抗原）とに分かれている。芯にはHBc抗原のほかにHBe抗原とDNAポリメラーゼやHBV-DNAが存在している。
デ－ン粒子以外にもHBs抗原陽性の血液中には、小型粒子、管状粒子といわれるデ－ン粒子の表面と同じ成分、すなわちHBs抗原を表面に有する粒子があるが、これらはいわば‘抜け殻’であり、HBs抗原を有するものの感染力はない。そこで血液中でHBs抗原が陽性を示した場合には、２つの意味があり、１つはB型肝炎ウイルスそのものが多い場合で、このような血液ではHBe抗原、DNAポリメラーゼ、HBV-DNAがいずれも陽性を示し、感染力もきわめて強い状態で、肝炎も活動性であることが多い（野生株）。もう１つはHBs抗原が陽性でも、ウイルスの抜け殻だけが血液中に存在する場合で、このような血液ではHBe抗体が陽性で、DNAポリメラーゼ、HBV-DNAも陰性であり、感染力はあっても極めて弱い状態である。HBe抗原からHBe抗体へのセロコンバージョンは、従来は宿主の免疫反応の変化でHBVが排除されることにより起こると考えられていたが、実はHBVの消失ではなく、単にHBe抗原を産生する野生株がHBe抗原非産生の変異株に置き換わる現象であり、一般的にはHBVの増殖もおさまり肝炎は沈静化する。しかし近年、HBe抗体が陽性で、DNAポリメラーゼ、HBV-DNAが陽性で、感染力も強い変異株が漸増しており、HBe抗体陽性であっても、DNAポリメラーゼ、HBV-DNAが陽性か陰性かを検査することが重要である。
③C型肝炎ウイルス（HCV）の検査
C型急性肝炎の急性期には本抗体は出現せず、発病後３～６ヶ月後に陽転化し て初めて診断可能であり、急性期診断としては、血清中のHCV-RNAを検出することが重要である。C型慢性肝炎においては、インターフェロン治療の反応性に強く関与するHCV-RNA量とHCVのサブタイプ（遺伝子型、血清型：グルーピング）がきわめて重要な検査である。HCV-RNA量の測定には、アンプリコア定性法と定量法（オリジナル法）があったが、最近さらに幅広い定量性を示すハイレインジ法が開発されており、臨床応用されている。最もHCV-RNAを感度よく検出できるのは、アンプリコア定性法、次いでオリジナル法、幅広く定量可能なものがハイレインジ法である。またHCVのサブタイプには遺伝子型（genotype）と血清型（serotype、グルーピング）があります。わが国に多いのはgenotype 1b型（グループ１）で65～70％を占める。genotype1a型は本邦ではほとんど認められず、日本においてserotype1はgenotype1b型を表している。genotype2a（グループ２）は 20～25%、genotype2b（グループ２）は10％前後を占め、いずれもserotype2に分類される。後述するがserotype2はserotype1と比べてインターフェロン治療に奏効しやすいことから、HCVグルーピングの検査は治療効果の予測にも有用である。
④E型肝炎ウイルス(HEV)の検査
IgM型HEV抗体、IgG型HEV抗体検査が自費で外注検査会社で測定できる。E型急性肝炎の診断には、PCR法によるHEV-RNAの検出が最も信頼できる検査であるが、現在までに保険適用されていない。
⑤自己抗体検査
抗核抗体(ANA)、抗平滑筋抗体(ASMA)は自己免疫性肝炎の血清学的診断法として有用である。また抗ミトコンドリア抗体（AMA）、あるいはミトコンドリアM2
抗体は、原発性胆汁性肝硬変の診断に欠くことのできない検査である。